軟籽石榴苗的灌溉必須根據氣候條件的變化靈活掌握。一般來說，春季到初夏，苗木處于旺盛生長期，南方雨水多，只要灌溉三四次即可。北方是干旱期，要灌七八次。播種苗、扦插苗則需要灌溉次數更多。

初夏：南方是陰雨季節，要注意排水。

夏季：北方常逢雨季，可不灌水。南方則不同，如果高溫又干旱，必須增加灌水次數。

秋季：雖然南北方雨量不同，但為了讓苗木組織充實和木質化，準備越冬，一般不灌水。

冬季：南方不灌水，北方則要在土地冰凍前灌一次凍水，以利于苗木越冬

夏季是軟籽石榴樹苗的生長期，春天種下，就靠夏季生長了，夏季溫度高，水分蒸發快，足夠的澆灌水量是成長的根本。滿足基礎條件以后，開始細節上的管理。

軟籽石榴樹苗屬于萌芽力強喜光的樹種，樹苗的樹冠內的枝條分布上稀下密，以使內外能通風透光。在冬季整形修剪的基礎上，夏季要進行摘心，對軟籽石榴樹苗旺枝進行短截或摘除嫩枝，并要注意抹去萌芽，以減少對養分的消耗。

1、軟籽石榴樹苗整形：即對較直的主枝用撐拉法將其引向不同的方向，開張角度40°～50°，以展開軟籽石榴樹苗樹冠，增加光照，提高枝條質量，促成花形成。

2、軟籽石榴樹苗抹芽：對于樹干基部及開張主枝背上萌發的枝條要及時抹除，以防養分消耗，如樹冠內膛空隙較大，可在開張主枝背上適宜部位留適量的萌發條，對軟籽石榴樹苗進行摘心，控制高生長，促發側枝，培養成內膛結果枝組。

3、軟籽石榴樹苗花果管理：軟籽石榴幼樹一般成花量較大，一個結果枝頂端同時著生2～5朵花。根據整株軟籽石榴樹苗樹木花量的多少，在能夠辨認出雌花和雄花的時候，進行適量疏花。花量較多，每個軟籽石榴樹苗結果枝可留一朵飽滿的雌花或雄花，其余的利用尖頭鑷子全部除掉，雌雄花比例一般為4∶1至5∶1為宜。

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